بررسی ژن‏ های رفرنس موجود در برگ کنجد تحت تنش شوری به روش real- time pcr

تجزیه و تحلیل بیان ژن جزء لاینفک مطالعات ژنومیکس کاربردی در همه موجودات زنده بشمار می‏رود.  real-time pcr تکنیک بسیار قوی برای بررسی بیان کمی ژن می‏باشد. با این حال، علاوه بر قابل اعتماد بودن، دارای یک سری مشکلات خاص، از جمله انتخاب‏ ژن (های) کنترل داخلی مناسب برای نرمال‏سازی داده‏ها می‏باشد. این تحقیق در خصوص انتخاب ژن‏های رفرنس در گیاه کنجد در مراحل مختلف نمو و تحت تنش شوری، مورد بررسی قرار گرفت .بدین منظور چهار ژن کنترل داخلی شامل alpha- tubulin، beta- actin، eif4- a و ubq5 که معمولاً به عنوان ژن خانه‏دار در گیاهان استفاده می‏شود انتخاب و  پایداری بیان آنها در سطوح مختلف شوری (صفر و 75 میلی‏مولار) و مراحل مختلف نموی در شش دوره زمانی (0 ساعت، 6 ساعت، 1 روز، 4 روز، 8 روز و 16 روز) در بافت برگ مورد بررسی قرار گرفتند. بررسی بیان ژن‏های رفرنس با استفاده از نرم‏افزار genorm نشان داد که ژن‏های eif4- a و beta-actin از پایداری بیان بیشتری نسبت به سایر ژن های مورد بررسی در مراحل نمو و تنش شوری در نمونه بافت برگی برخوردار بودند. استفاده از این ژن ها می تواند در نرمال سازی بیان ژن به وسیله آنالیز real-time pcr مفید باشد. نتایج این تحقیق را می‏توان به عنوان ژن‏های رفرنس درآنالیز بیان ژن در real-time pcr در گیاه کنجد استفاده نمود.